一、醫(yī)院審計中存在的主要問題
　　(一)審計監(jiān)督工作滯后
　　當前醫(yī)院基建項目審計工作主要是對項目完工后進行的決算審計，無法對基建工程進行全過程的監(jiān)督，特別是基建維修項目，審計部門根本就無法掌握情況。管基建維修的科室不及時整理送審資料，有的維修項目已維修了好幾年還沒有結(jié)賬。甚至維修項目已拆除還沒結(jié)賬，以致于維修項目中的許多內(nèi)容無法核實，建設過程中存在的問題無法及時發(fā)現(xiàn)，審計監(jiān)督根本就到不了位。
　　(二)審計工作方法落后
　　許多單位領導沒有信息化管理意識，不愿意投入更多的經(jīng)費在審計工作上，有的審計科電腦都沒有，即便有電腦也沒有配備基建審計軟件，審計還是采用手工方法進行核對，這樣不僅工作量大，而且數(shù)字核對不準，效率低下，嚴重影響了審計工作的開展。有的單位由于缺乏專業(yè)審計人員，根本就不進行審計，直接根據(jù)施工方的送審價進行打折，造成送審方虛報送審價。
　　(三)審計職責不清
　　審計是由專職機構(gòu)和人員對被審計單位的財政、財務收支及其他經(jīng)濟活動的真實性、合法性和效益性進行審查和評價的獨立的經(jīng)濟監(jiān)督活動。審計的基本職能是監(jiān)督，而且是經(jīng)濟監(jiān)督，是以第三者身份所實施的監(jiān)督。目前，許多醫(yī)院管基建維修的科室沒有配備專門的基建預決算員，只知道讓基建隊人員施工，不要求對方做預算圖和造價預算，協(xié)商項目也不與對方談價，僅僅是在結(jié)算時核對一下工程量，根本就不知道套定額，最后談價和套定額的任務就落到了審計部門身上。審計部門變成了既是執(zhí)行者，又是監(jiān)督者，導致職責不清，容易引起腐敗現(xiàn)象的發(fā)生。
　　(四)審計人員配置不合理
　　單位領導不重視內(nèi)審工作，內(nèi)審機構(gòu)不健全，人員配置不合理。有的將紀檢、監(jiān)察、審計放一個部門辦公，還有的雖然設立了工程審計崗，但不是專業(yè)工程審計人員，有的即使是配備了專業(yè)工程審計人員，但人員配置不是根據(jù)工作任務、工作量而定的，隨意配置1至2人，導致從事工程審計的人員數(shù)量少與工程審計任務繁重的矛盾日益突出，造成工程審計人員長期超負荷工作，嚴重影響了工程審計的效果。
　　(五)聘請的會計師事務所審計質(zhì)量不高
　　按照審計法的相關規(guī)定，基建項目達到一定的金額就必須請社會中介機構(gòu)進行審計。在委托社會中介機構(gòu)開展審計工作中，往往會存在一些問題，而醫(yī)院卻無法進行有效的監(jiān)督管理。1、在實施審計過程中，受托社會中介機構(gòu)串通被審計人或單位，泄露與被審計項目有關的秘密，嚴重違反職業(yè)道德，給醫(yī)院造成經(jīng)濟損失。2、對有害于醫(yī)院經(jīng)濟利益。爭議較大的方面，不經(jīng)院方代表到場，私自拍板定案。3、在套用定額和材料價格上不從實際出發(fā)，工作不認真負責，不到施工現(xiàn)場查看所用材料。不核實工程量。以致于核減幅度比較少，醫(yī)院基建開支顯著增加。