2．審計對象不同。一般目的審計的具體對象是會計期間的資產負債表、損益表、現金流量表及會計報表附注；清算審計的具體對象是清算資產負債表、清算損益表、清算財產分配表及清算事項說明。
一般審計對象的資產負債表期初數是上年度期未數結轉數，期未數是當年會計期期末累計數；清算資產負債表期初數是企業(yè)終止經營時的資產負債表期末數結轉數，期末數是清算期終結時的清算累計數。
3．審計基準不同。一般目的審計的基礎是《企業(yè)會計準則》和《行業(yè)會計制度》；清算審計的基準除以上內容外，還要根據《公司法》、《破產法》、《外商投資企業(yè)清算辦法》的有關規(guī)定。
4．審計重點不同。一般目的審計重點是檢查會計事項的存在或發(fā)生、完整性、會計報表是否存在重大錯報，評價管理當局采用的會計政策和作出的重大的會計估計，以及評價會計報表的整體反映與披露；清算審計除了上述內容外，還要對資產的清算價格是否適宜，負債的減免及償付原因，有無對債權的放棄行為，有無未入賬的清算收入，清算資產的分配是否合規(guī)等進行審計。
四、企業(yè)清算審計的基本內容
1．企業(yè)清算開始時的資產負債表及相關會計資料、債權債務清冊和財產清單。
2．企業(yè)清算方案及實施情況，包括清算期的財產變現情況。
3．清算期清算費用的開支和損益的計算情況。
4．剩余財產存在的真實情況及分配情況。
5．企業(yè)清算結束后的資產負債是否確實存在。
五、根據清算審計的基本內容，運用專業(yè)判斷，進行實質性測試獲取審計證據，形成工作底稿。對清算中漏報、錯報的資產、負債、損益進行審計差異匯總，調整清算資產負債表、清算損益表、清算財產分配表，編制已審清算資產負債表、損益表、財產分配表及清算事項說明。
六、清算審計報告
1．清算審計屬于特殊目的審計報告，標題點明期特殊性，通常是“關于××公司的清算審計報告”；
2．收件人，是“××公司清算委員會（或清算領導小組）”；
3．引言段。應當說明下列內容：
（1）已審清算會計報表的名稱，日期或涵蓋的期間。即清算資產負債表的日期是××年×月×日；清算損益表期間是××年×月×日——××年×月×日；清算財產分配表期間是××年×月×日——××年×月×日。
（2）雙方責任，清算會計報表及清算方案的編制是××公司清算委員會（或清算領導小組）負責，我們的責任是對清算會計報表發(fā)表審計意見。