根據《財政部 商務部 稅務總局關于繼續執行研發機構采購設備增值稅政策的公告》（2019年第91號，以下簡稱91號公告）規定，稅務總局配套制發了《研發機構采購國產設備增值稅退稅管理辦法》（以下簡稱《辦法》）。現解讀如下：

一、《辦法》出臺的背景

為鼓勵科學研究和技術開發，減輕研發機構研發成本，經國務院批準，財政部會同商務部和稅務總局發布了91號公告，明確自2019年1月1日至2020年12月31日，繼續對研發機構（包括內資研發機構和外資研發中心）采購國產設備全額退還增值稅，并規定具體退稅管理辦法由稅務總局會同財政部制定。為落實91號公告，便于研發機構辦理采購國產設備退稅，經商財政部，稅務總局出臺了《辦法》。

二、《辦法》的主要內容解讀

（一）研發機構和國產設備的具體范圍

辦理增值稅退稅的研發機構和國產設備的具體范圍，按照91號公告第一條、第二條和第四條的規定執行。

（二）研發機構如何辦理采購國產設備退稅備案

適用采購國產設備退稅政策的研發機構，應于首次申報采購國產設備增值稅退稅時辦理退稅備案手續。辦理手續時需要的相關資料包括研發機構資質證明資料、《出口退（免）稅備案表》等。需要提醒的是，《出口退（免）稅備案表》內容填寫要真實、完整，其中，“企業類型”選擇“其他單位”，“出口退（免）稅管理類型”依據資質證明材料填寫“內資研發機構（簡寫：內資機構）”或“外資研發中心（簡寫：外資中心）”，其他欄次按填表說明填寫。

《辦法》下發前已辦理采購國產設備退稅備案的研發機構，無需再次辦理備案。

（三）研發機構如何辦理采購國產設備退稅備案的變更和撤回

1.如何辦理備案變更。已辦理備案的研發機構，《出口退（免）稅備案表》中內容發生變更的，須自變更之日起30日內，持相關資料向主管稅務機關辦理備案變更。

2.如何辦理撤回。研發機構發生解散、破產、撤銷以及其他依法應終止采購國產設備退稅事項的，應持相關資料向主管稅務機關辦理備案撤回。主管稅務機關應按規定結清退稅款后，辦理備案撤回。外資研發中心在退稅資格復審前，因自身條件發生變化，已不符合研發機構的條件，應自條件變化之日起30日內辦理退稅備案撤回。

（四）研發機構如何進行退稅申報

研發機構申報采購國產設備退稅時，需提交《購進自用貨物退稅申報表》、采購國產設備合同、增值稅專用發票或者增值稅普通發票等資料。可辦理的退稅額，為增值稅發票上注明的稅額。

上述增值稅發票的具體要求：1.增值稅專用發票，在增值稅發票綜合服務平臺上線后，應當已通過增值稅發票綜合服務平臺確認用途為“用于出口退稅”；在增值稅發票綜合服務平臺上線前，應當已經掃描認證通過，或者已通過增值稅發票選擇確認平臺勾選確認。2.增值稅普通發票，為開具時間為2019年1月1日至本公告發布之日前的增值稅普通發票[不含增值稅普通發票(卷票）]。

研發機構采購國產設備取得的增值稅專用發票，已用于進項稅額抵扣的，不得申報退稅；已用于退稅的，不得用于進項稅額抵扣。

（五）研發機構辦理退稅的申報期限

研發機構采購國產設備退稅的申報期限，為采購之日次月起至次年4月30日前的各增值稅納稅申報期。考慮到新冠肺炎疫情影響，2019年采購國產設備退稅的申報期限，延長至2020年8月31日前的各增值稅納稅申報期。

如果研發機構未能在規定的期限內申報退稅，根據《財政部 稅務總局關于明確國有農用地出租等增值稅政策的公告》（2020年第2號）的規定，待研發機構收齊憑證及信息后，仍可繼續申報辦理退稅。

（六）稅務機關如何審核辦理退稅

如果研發機構屬于增值稅一般納稅人，稅務機關經審核符合規定的，應按規定辦理退稅。如果研發機構不是增值稅一般納稅人，或者雖然是增值稅一般納稅人、但使用增值稅普通發票申報退稅的，稅務機關須確認發票真實、發票所列設備已申報納稅后，方能辦理退稅。

（七）已退稅的國產設備轉移或移作他用如何處理

已辦理增值稅退稅的國產設備，自增值稅發票開具之日起3年內，設備所有權轉移或移作他用的，研發機構須按照規定向主管稅務機關補繳已退稅款。補繳已退稅款按以下方法計算：

應補繳稅款＝增值稅發票上注明的稅額×（設備折余價值÷設備原值）

設備折余價值＝增值稅發票上注明的金額-累計已提折舊    

累計已提折舊按照企業所得稅法的有關規定計算。

（八）違法違規的處理

如果研發機構騙取采購國產設備增值稅退稅的，主管稅務機關應追回已退稅款，并依照稅收征管法的有關規定處理。如果研發機構涉及重大稅收違法失信案件被依法公布信息的，研發機構將停止享受采購國產設備退稅政策，并應及時辦理退稅備案撤回。

三、執行期限

根據91號公告規定，《辦法》的施行期限為2019年1月1日至2020年12月31日，以增值稅發票的開具日期為準。